Máster en Bioinformática y Bioestadística - Online - UOC Universitat Oberta de Catalunya - I33415

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Máster en Bioinformática y Bioestadística - Online
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Método: Online
Tipo: Master
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Máster en Bioinformática y Bioestadística - Online Comentarios sobre Máster en Bioinformática y Bioestadística - Online
Titulación:
Una vez superado el proceso global de evaluación, la UOC otorgará un diploma de Máster en Bioinformática y bioestadística a los participantes que acrediten una titulación universitaria legalizada en España.

En el caso de no disponer de esta titulación, se expedirá un Certificado en Bioinformática y bioestadística
Contenido:

Primer semestre: Bioinformática: genómica computacional

1. Fundamentos de informática en entornos bioinformáticos (5 ECTS)

1.1. Linux (2 ECTS)

    * Línea de comandos

    * Navegación por el sistema de ficheros

    * Herramientas básicas


1.2. Perl/BioPerl (2 ECTS)

    * Comandos del lenguaje

    * Entorno de ejecución

    * Depuración de errores


1.3. PHP/MySQL (1 ECTS)

    * Presentación del modelo relacional

    * Comandos útiles

    * Entornos de trabajo


2. Fundamentos de biología molecular (5 ECTS)

2.1 ¿Qué es la vida y qué la caracteriza? (1 ECTS)

    * Organismos y células

    * Procariotas y eucariotas

    * Clasificación en reinos

    * Las moléculas de la vida

    * Pequeñas moléculas

    * Proteínas

    * El ADN (ácido desoxirribonucleico)

    * El ARN (ácido ribonucleico)

    * Transmisión de información

    * Replicación del ADN

    * Mitosis

    * Meiosis

    * Recombinación


2.2 Genes y genomas (1 ECTS)

    * Genética clásica: Leyes de Mendel

    * El gen a nivel molecular

    * Ligamiento y herencia ligada al sexo

    * Otros tipos de herencia biológica

    * Genomas

    * Secuenciación de genomas

    * Predicción y anotación de genomas


2.3. De genes a proteínas (1 ECTS)

    * Transcripción

    * Splicing

    * Traducción

    * Regulación de la expresión génica


2.4. Variación genética (1 ECTS)

    * Variación genética y evolución

    * La teoría de la selección natural de Darwin

    * Tipos de mutación

    * Mutación y selección en poblaciones

    * Deriva genética

    * Fijación de mutaciones


2.5. Evolución de secuencias (1 ECTS)

    * Tasas evolutivas

    * Definición de árbol evolutivo

    * Métodos de distancia

    * Métodos de máxima parsimonia

    * Métodos de máxima verosimilitud

3. Genómica computacional (5 ECTS)

3.1. Búsqueda de información en bases de datos biológicas (1 ECTS)

    * Bases de datos de secuencias: NCBI, ENSEMBL

    * Bases de datos genómicas: ENSEMBL, UCSC

    * Bases de datos de proteínas (PFAM, SCOP, INTERPRO, PDB)

    * Datos de expresión: EST, STS, Unigene

    * Datos de referencia: RefSeq

    * Multibuscadores (Entrez, SRS, Biomart, UCSC)

    * Sistemas integrados (Entrez Gene, GeneCards)

    * HapMap

    * Ontologías: GO


3.2. Alineamiento de secuencias (1 ECTS)

    * Introducción histórica

    * Alineamiento de dos secuencias (programación dinámica)

    * Alineamiento múltiple

    * Matrices de sustitución

    * Búsqueda de secuencias similares en bases de datos

    * Motivos en secuencias (patrones y perfiles)


3.3. Anotación de genomas (1 ECTS)

    * Secuenciación de genomas (proyectos genoma, organismos secuenciados, árbol de la vida)

    * Secuenciación y ensamblaje de genomas

    * Necesidad de herramientas computacionales

    * Métodos y algoritmos de predicción de genes (ab initio, por similaridad)

    * Genes que no codifiquen por proteínas

    * Regulación de la expresión de un gen: promotores y elementos reguladores

    * Anotación funcional (manual y automática)


3.4. Genómica funcional y de sistemas (1 ECTS)

    * Biología de sistemas

    * Redes de regulación genética

    * Redes metabólicas

    * Redes de interacción de proteínas

    * Microarrays

    * Bioinformática y salud

Segundo semestre: Bioinformática: microarrays, biología estructural y tendencia
 

1. Genómica funcional y análisis de microarrays (5 ECTS)

1.1. Introducción a la genómica funcional y a las tecnologías high throughput (1,5 ECTS)

    * El objeto de estudio de la genómica funcional

    * Métodos de obtención de datos de alto rendimiento

    * Perspectiva general

    * Microarrays de expresión génica

    * Otros tipos de datos (SNP, ChIP, proteómica)

1.2. El lenguaje de programación R (1,5 ECTS)

    * R, software libre para estadística y los gráficos

    * Manejo de datos en R

    * Gráficos

    * Estadística básica y avanzada

    * Programación: scripts, funciones y mucho más


1.3. Análisis de datos de microarrays (1 ECTS)

    * Perspectiva general del análisis de datos de microarrays de expresión

    * Lectura y control de calidad de las imágenes

    * Preprocesado: normalización y filtraje

    * Detección de genes diferencialmente expresados

    * Busca de patrones de coexpresión mediante análisis de clusters

    * Diagnósticos moleculares y métodos de clasificación

    * La ontología génica y sus aplicaciones para la interpretación biológica

    * Más allá de la expresión génica: análisis de factores de transcripción e integración de distintos tipos de datos


1.4. Biología de sistemas (BS) y genómica funcional (1 ECTS)

    * Introducción a la biología de sistemas

    * Tipos de redes y técnicas para su análisis y reconstrucción

    * Reconstrucción de redes metabólicas a partir de datos de alto rendimiento

    * Perspectivas y aplicaciones de la BS


2. Biología estructural (4 ECTS)


2.1. Conceptos básicos (0,7 ECTS)

    * Biología estructural

    * Moléculas

    * Biomoléculas

    * Macromoléculas


2.2. Proteínas (0,6 ECTS)

    * Síntesis, tipos, funciones, propiedades

    * Estado natural/desnaturalizado

    * Estructura primaria

    * Estructura secundaria

    * Estructura terciaria

    * Estructura cuaternaria

    * Dominios estructurales

    * Plegado de proteínas

    * Bases de datos


2.3. Predicción de estructura (1) (0,6 ECTS)

    * Proteínas solubles

    * Cristalografía

    * NMR


2.4. Predicción de estructura (2) (0,6 ECTS)

    * Homología

    * Threading ab initio

    * CASP


2.5. Estructura de ácidos nucleicos (0,6 ECTS)


    * ADN

    * ARN


2.6. Modelado molecular (0,6 ECTS)

 
    * Átomos, campos de fuerza, interacciones

    * Simulaciones

    * Diseño de fármacos


3.- Aplicaciones y tendencias del sector bioinformático (3 ECTS)


3.1. Aplicaciones (0,75 ECTS)


    * Introducción. La investigación en la industria farmacéutica

    * Descubrimiento de (potenciales) nuevas dianas terapéuticas

    * Descubrimiento y mejora de fármacos


3.2. El sector (0,75 ECTS)

 
    * Empresas de bioinformática

    * Uso de la bioinformática en el entorno de la investigación

    * Uso de la bioinformática en el entorno empresarial

    * Uso de la bioinformática en las organizaciones sanitarias


3.3. Tendencias de futuro (0,75 ECTS)
 

    * Biología de sistemas

    * Ontologías, clasificaciones y diccionarios

    * Integración de la información biomédica

    * Vigilancia tecnológica


3.4. Marco legal (0,75 ECTS)
 

    * Propiedad industrial y derechos de autor

    * Ley de protección de datos de carácter personal

    * Ley del medicamento

    * Ley de investigación biomédica

    * Directivas europeas


4.- Proyecto final de bioinformática (3 ECTS)

 
    Temas del proyecto:

        Genómica
        Biología estructural
        Aplicaciones y tendencias
        Libre


Tercer semestre: Bioestadística: fundamentos
 

1.- Fundamentos de bioestadística (5 ECTS)
 

    * Conceptos de probabilidad y bioestadística

    * Inferencia estadística

    * Métodos no paramétricos

 
2.- Modelos lineales (5 ECTS)
 

    * Regresión lineal

    * Análisis de la varianza

    * Diseño de experimentos

 
3.- Laboratorio de software estadístico (5 ECTS)
 

    * Análisis de datos en bioestadística

    * Programación estadística

 
Cuarto semestre: Bioestadística: métodos y modelos
 

1. Análisis de supervivencia (5 ECTS)
 

    * Análisis de supervivencia

    * Regresión logística


2. Análisis multivariante (5 ECTS)
 

    * Componentes principales

    * Análisis factorial

    * Análisis clúster

    * Modelos de ecuaciones estructurales

    * Análisis discriminante


4. Proyecto final de bioinformática (5 ECTS)


Inicio: 19 octubre 2011

Precio: 3.927.01 euros

Duración: 2 años (480 horas)

Nro. de créditos: 32 ECTS

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